R Bioinformatics Cookbook Ebook Tooltip Use R and Bioconductor to perform RNAseq, genomics, data visualization, and bioinformatic analysis

Auteur: Dan Maclean
Taal: Engels

Afbeeldingen
Inkijkexemplaar

Artikel vergelijken

Bekijk nu
Auteur: Dan Maclean
  • Engels
  • E-book
  • 9781789955590
  • 11 oktober 2019
  • Adobe ePub
Alle productspecificaties
  • Je leest ebooks gemakkelijk op je Kobo e-reader, of op je smartphone of tablet met de bol.com Kobo app. Let op! Ebooks kunnen niet geannuleerd of geretourneerd worden.

Samenvatting

Over 60 recipes to model and handle real-life biological data using modern libraries from the R ecosystem

Key Features
  • Apply modern R packages to handle biological data using real-world examples
  • Represent biological data with advanced visualizations suitable for research and publications
  • Handle real-world problems in bioinformatics such as next-generation sequencing, metagenomics, and automating analyses
Book DescriptionHandling biological data effectively requires an in-depth knowledge of machine learning techniques and computational skills, along with an understanding of how to use tools such as edgeR and DESeq. With the R Bioinformatics Cookbook, you’ll explore all this and more, tackling common and not-so-common challenges in the bioinformatics domain using real-world examples. This book will use a recipe-based approach to show you how to perform practical research and analysis in computational biology with R. You will learn how to effectively analyze your data with the latest tools in Bioconductor, ggplot, and tidyverse. The book will guide you through the essential tools in Bioconductor to help you understand and carry out protocols in RNAseq, phylogenetics, genomics, and sequence analysis. As you progress, you will get up to speed with how machine learning techniques can be used in the bioinformatics domain. You will gradually develop key computational skills such as creating reusable workflows in R Markdown and packages for code reuse. By the end of this book, you’ll have gained a solid understanding of the most important and widely used techniques in bioinformatic analysis and the tools you need to work with real biological data. What you will learn
  • Employ Bioconductor to determine differential expressions in RNAseq data
  • Run SAMtools and develop pipelines to find single nucleotide polymorphisms (SNPs) and Indels
  • Use ggplot to create and annotate a range of visualizations
  • Query external databases with Ensembl to find functional genomics information
  • Execute large-scale multiple sequence alignment with DECIPHER to perform comparative genomics
  • Use d3.js and Plotly to create dynamic and interactive web graphics
  • Use k-nearest neighbors, support vector machines and random forests to find groups and classify data
Who this book is for

This book is for bioinformaticians, data analysts, researchers, and R developers who want to address intermediate-to-advanced biological and bioinformatics problems by learning through a recipe-based approach. Working knowledge of R programming language and basic knowledge of bioinformatics are prerequisites.

Productspecificaties

Inhoud

Taal
en
Bindwijze
E-book
Oorspronkelijke releasedatum
11 oktober 2019
Ebook Formaat
Adobe ePub
Illustraties
Nee

Betrokkenen

Hoofdauteur
Dan Maclean
Hoofduitgeverij
Packt Publishing

Lees mogelijkheden

Lees dit ebook op
Desktop (Mac en Windows) | Kobo e-reader | Android (smartphone en tablet) | iOS (smartphone en tablet) | Windows (smartphone en tablet)

Overige kenmerken

Editie
1
Studieboek
Ja

EAN

EAN
9781789955590

Je vindt dit artikel in

Categorieën
Beschikbaarheid
Leverbaar
Boek, ebook of luisterboek?
Ebook
Taal
Engels
Beschikbaar in Kobo Plus
Beschikbaar in Kobo Plus

Reviews
Nog geen reviews
Hoe controleren en plaatsen wij reviews? Hoe controleren en plaatsen wij reviews?

Negatief, positief, neutraal: we zetten een review altijd online. We controleren wel eerst of ’ie voldoet aan onze reviewvoorwaarden en niet nep is. We controleren ook of ’ie is geschreven door iemand die het artikel heeft gekocht via bol.com en zetten dit er dan bij. De controles gebeuren automatisch, al kijken er soms mensen mee. Bol.com betaalt niet voor reviews. Als een reviewer door een andere partij is vergoed, staat dit in de review zelf.

Kies gewenste uitvoering

Kies je bindwijze (2)
E-book €35,99 E-book in Kobo Plus Gratis voor abonnees Paperback €67,07
Editie : 1

Prijsinformatie en bestellen

De prijs van dit product is 35 euro en 99 cent.
Direct beschikbaar
Verkoop door bol
Ebook
  • E-book is direct beschikbaar na aankoop
  • E-books lezen is voordelig
  • Dag en nacht klantenservice
  • Veilig betalen
Houd er rekening mee dat je downloadartikelen niet kunt annuleren of retourneren. Bij nog niet verschenen producten kun je tot de verschijningsdatum annuleren.
Zie ook de retourvoorwaarden

Anderen bekeken ook

Bekijk de hele lijst